Cet atelier de deux jours vous est offert par le CINQ et le RBIQ. Il regroupe plus de 15 spécialistes qui offriront une formation théorique et pratique unique sur les
analyses de connectivité en neuroimagerie multimodale (EEG/MEG et l'IRM).
L'École se déroule sur deux jours et inclut une conférence plénière, neuf conférences invitées ainsi que trois ateliers pratiques portant sur trois logiciels d'analyse de connectivité : Brainstorm, Neuropype et NIAK.
L'École d'été aura lieu les lundi et mardi 15 et 16 mai 2017 au Domaine Cataraqui, à Québec.
Pascale Tremblay, Ph. D.
Professeure agrégée, Département de réadaptation, Université Laval
Chercheuse, Centre de recherche CERVO
Co-directrice, Consortium d'imagerie en neurosciences et santé mentale de Québec (CINQ)
Karim Jerbi, Ph. D.
Professeur agrégé, Département de psychologie, Université de Montréal
Chaire de recherche du Canada en neurosciences et neuroimagerie cognitive
Julien Doyon, Ph. D.
Professeur titulaire, Département de psychologie, Université de Montréal
Directeur scientifique du Réseau de bioimagerie du Québec (RBIQ)
Directeur scientifique de l’Unité de Neuroimagerie Fonctionnelle (UNF)
Philip Jackson, Ph. D.
Professeur titulaire, Département de psychologie, Université Laval
Chercheur, CIRRIS et CERVO
Co-directeur, Consortium d'imagerie en neurosciences et santé mentale de Québec (CINQ)Sophie Bélanger-Lebel, B. A.
Responsable communication et activités scientifiques, Consortium d'imagerie en neurosciences et santé mentale de Québec (CINQ)
Neural
dynamics of the primate attention network
Sabine Kastner, Ph. D.
Professeure, Département de psychologie et neurosciences, Princeton University
Directrice scientifique du centre de neuroimagerie de Princeton
Directrice du Neurosciences of attention and perception laboratory
Karim Jerbi, Ph. D.
Professeur agrégé, Département de psychologie, Université de Montréal
Chaire de recherche du Canada en neurosciences et neuroimagerie cognitive
Louis J. Dubé, Ph. D.
Professeur titulaire, Département de physique, génie physique et d'optique, Université Laval
Directeur, Dynamica Research Group, Université Laval
Bratislav Misic, Ph. D.
Professeur adjoint, Département de neurologie et de neurochirurgie, Université McGill
Fondateur et directeur, Network neuroscience laboratory, Université McGill
Matt Brookes, Ph. D.
Professeur agrégé, École de physique et astronomie, Université de Nottingham, Angleterre
Chercheur, Sir Peter Mansfield Imaging Centre, Université de Nottingham
Maxime Descôteaux, Ph. D.
Professeur agrégé, Département d'informatique, Université de Sherbrooke
Directeur, Laboratoire d'imagerie de la Connectivité de Sherbrooke
Pierre Bellec, Ph. D.
Professeur adjoint, Département d'informatique et de recherche opérationnelle, Université de Montréal
Chercheur, Unité de neuroimagerie fonctionnelle, Centre de recherche, Institut universitaire de gériatrie de Montréal (IUGM)
Stéfanie Blain-Moraes, Ph. D.
Professeure adjointe, École de physiothérapie et d'ergothérapie, Université McGill
Directrice, Biosignal Interaction and Personhood technology laboratory, Université McGill
Professeure, Département de psychologie Université de Montréal
Chercheuse, Centre d'études avancées en médecine du sommeil à l'Hôpital du Sacré-Coeur, Montréal
Sylvain Baillet, Ph. D.
Professeur, Neurologie, neurochirurgie et génie biomédicale, Université McGill
Directeur, Centre d'imagerie cérébrale McConnell de l'Université McGill
Annalisa Pascarella, Ph. D.
Chercheuse, Istituto per le Applicazioni del Calcolo, National Research Council, Rome
Trois ateliers pratiques seront offerts en parallèle au cours de la journée du 16 mai. Les participants et participantes auront la possibilité de s'inscrire à l'atelier de leur choix (à noter que le nombre de places par atelier est limité afin de favoriser l'apprentissage).
L'atelier Brainstorm sera animé par :
Sylvain Baillet, Ph. D.
Professeur, Neurologie, neurochirurgie et génie biomédicale, Université McGill
Chercheur senior, Fonds de recherche Santé Québec (FQRS)
Directeur, Centre d'imagerie cérébrale McConnell de l'Université McGill
Elizabeth Bock, MSc
Responsable de laboratoire, MEG Lab, Centre d'imagerie cérébrale McConnell
The neuroimaging analysis kit (NIAK) is a library of pipelines for the preprocessing and mining of connectomes extracted from large functional magnetic resonance imaging data, using GNU Octave. NIAK offers a catalogue of robust, validated workflows for complex tasks such as registration and denoising of brain images, as well as data-driven functional brain parcellation or connectome-wide association studies. NIAK is an open-source software distributed under MIT license. Linux, Mac OSX and Windows are supported using docker.
L'atelier NIAK sera animé par :
Pierre Bellec, Ph. D.
Professeur adjoint, Département d'informatique et de recherche opérationnelle, Université de Montréal
Chercheur, Unité de neuroimagerie fonctionnelle, Centre de recherche de l'Institut universitaire de gériatrie de Montréal (IUGM)
Pierre-Olivier Quirion, Ph. D.
Administrateur de systèmes, Unité de neuroimagerie fonctionnelle, Centre de recherche de l'Institut universitaire de gériatrie de Montréal (IUGM)
NeuroPype is a new open-source multi-modal brain data analysis kit which provides Python-based pipelines for advanced multi-thread processing of fMRI, MEG and EEG data, with a focus on connectivity analyses. A major strength of the NeuroPype is that it relies on (and interfaces with) several freely available Python packages developed for efficient and fast parallel processing and that it seamlessly connects with existing open-science neuroimaging and signal processing toolboxes. In particular, the NeuroPype framework is powered by the nipype engine [A] and allows for quick development of powerful processing pipelines for neuroimaging and electrophysiology data analysis. The flexible design allows users to configure analysis pipelines that are defined by connecting multiple nodes, where each node may be a user-defined function or a well-established tool or python-wrapped module (e.g. MNE-python package for MEG analysis [2], FreeSurfer for automated brain segmentation or Radatools for graph theoretical metrics, etc.).
Target Audience: Students and researchers with an interest in advanced brain network analysis using MEG, EEG or fMRI. Requirements: Basic knowledge of (or a keen interest in) Python.
References:
1. Gorgolewski et al. (2011) Front. Neuroinform. 5:13
2. Gramfort et al. (2013), Front. Neurosci. 7:267
L'atelier NeuroPype sera animé par :
Annalisa Pascarella, Ph. D.
Chercheuse régulière, Istituto per le Applicazioni del Calcolo, National Research Council, Rome
David Meunier, Ph. D.
Ingénieur de recherche, Centre de Recherche en Neurosciences de Lyon (CRNL), Labex Cortex, Université de Lyon, Lyon, France
L'inscription à l'École d'été sur la connectivité multimodale comprend :
Accès à toutes les conférences
Un atelier pratique
Déjeuner et dîner lors de chacune des journées
Plusieurs pauses-café
Un cocktail réseautage le 15 mai
Un souper au Domaine Cataraqui le 15 mai
Inscription réservée aux membres du CINQ ou du RBIQ :
Étudiants et étudiantes de premier cycle : 60$
Étudiants et étudiantes de 2e et 3e cycles et postdocs : 70$
Professeur(e)s, professionnel(le)s de recherche, clinicien(ne)s : 125$
Afin de vous inscrire à l'École d'été,
vous devez être affilié(e) à une université et membre du CINQ ou du RBIQ.
Toute inscription ne répondant pas à ce critère pourra être annulée ou refusée.